2024年12月9日至12月31日，南宝航线将实行冬至航班计划，调整后的航班时刻如下，其他航线航班暂保持不变。

元旦假期即将来临，为方便旅客渡江，2023年12月30日至2024年1月1日，新石线、南石线实行不定时航班。

自2023年9月16日起，上海客轮公司将开始实行秋季航班，其中南门—宝杨方向航班有所调整，其余高速船航线航班暂时不变。

因崇明南门港高速船码头前沿水域水深变浅，在低潮位时段已不能满足船舶安全靠离泊要求，为确保旅客安全出行，上海客轮公司将暂停低潮位时航班，现将8月3日调整后的南宝线航班公布如下。

受天气影响，5月17日5时35分起，上海客轮全线停航。5时45分起，崇明公交申崇七线、横长线停运。5时50分起，三淞线停航。

2023年4月29日至5月3日，为方便旅客渡江，调整南门—石洞口、新河—石洞口航线车客渡航班，首末班航班定时开航，中间时间段视现场车客流情况实行不定时航班。

受天气影响，2023年4月24日5时16分起，崇明公交申崇七线、横长线停运。5时45分起，上海客轮全线停航。

上海市交通委指挥中心提示，受天气影响，2023年4月4日，5时18分起，金定线停航；5时33分起，崇明公交申崇七线、横长线停运。

2023年3月1日起，上海客轮高速船将实行春季航班，调整南门—宝杨、堡镇—宝杨、南门—石洞口、吴淞—新河、吴淞—马家港、吴淞—横沙等航线，具体如下。

上海市客运轮船有限公司2022年9月4日发布停航公告，因受台风“轩岚诺”影响，目前我公司全线停航。

2022年8月12日起，恢复吴淞—新河高速船航线；调整南门—石洞口车客渡航线航班，调整后的航班时刻如下。其他航线航班暂保持不变。

2022年7月26日，长横对江渡航班全天停航；7月27日起逐步恢复航班，首班7:00；末班19:00。